Abra o Terminal e digite este texto para cada ícone que você deseja que seja visível na área de trabalho, se você estiver usando o gnome.
Para a pasta inicial:
gsettings set org.gnome.nautilus.desktop home-icon-visible true
Para o ícone do computador:
gsettings set org.gnome.nautilus.desktop computer-icon-visible true
Para ícones de volume:
gsettings set org.gnome.nautilus.desktop volumes-visible true