É possível que ele tenha saído da tela. Altere suas configurações de exibição para algo menor e, em seguida, volte para o que elas normalmente usavam. Isso provavelmente moverá a janela de volta na tela.
Se ainda estiver baixando o material (verifique um gerenciador de rede), você pode cancelá-lo com segurança ou simplesmente reiniciar, se desejar.
Se estiver usando muita CPU, provavelmente está instalando os pacotes, não cancele aqui. Se parecer que está inativo, provavelmente está aguardando alguma entrada do usuário durante a instalação. Embora não seja ideal, seria mais seguro cancelar ou interromper a instalação a meio caminho, se necessário.