Suponho que você esteja recebendo uma mensagem na tela solicitando que você formate a unidade quando entrar no Windows. Esse é normalmente o caso quando o Windows vê uma partição não reconhecida.
Acho que a melhor opção seria inicializar em um Live CD do Ubuntu em um computador funcional, escolher a opção "try Ubuntu" e ver se você pode ver seus arquivos.
Se você pode ver seus arquivos, então você pode fazer o backup deles em um disco rígido externo, caso contrário você pode procurar opções de recuperação de dados.