Quando você iniciar o VLC, pressione Ctrl + P . Isso deve abrir a janela Preferences para você. Agora selecione a aba Vídeo e sob a seção Exibir desabilite / desmarque "Saída de vídeo acelerada (Overlay)" , isso deve resolver o problema para você. JFYI, isso acontece porque você pode não ter o driver exato necessário para a sua placa gráfica, que em alguns casos é corrigido com uma atualização ou então requer que você instale um dos drivers proprietários disponíveis pelo fornecedor da sua placa de vídeo.