Sim, o Ubuntu suporta um desktop estendido em vários monitores por padrão. Apenas hoje eu trouxe meu Thinkpad com o Ubuntu 13.04 (Unity) para trabalhar com dois monitores externos e ambos foram detectados corretamente imediatamente. Nas configurações de "Exibições", você pode configurá-las ao seu gosto, conforme mostrado aqui:
Você pode acessar os monitores simplesmente pesquisando no painel ou acessando as Configurações do sistema > Exibe. Sua milhagem pode variar com base no seu chipset gráfico. Por exemplo, um chipset Nvidia pode ter suas configurações em um utilitário fornecido pela Nvidia, em vez de ser totalmente configurável a partir desta interface. No meu exemplo, o chipset é um Intel HD4000. Esteja ciente também de como os recursos de desempenho de sua placa gráfica afetarão o desempenho gráfico geral em um número cada vez maior de monitores com altas resoluções.