O erro que cometi no script acima é bastante estúpido. Eu não considerei que os comandos são sensíveis a maiúsculas e minúsculas. Aqui está o script de trabalho.
#!/bin/bash
xdotool key ctrl+l
xdotool key ctrl+c
xdotool key F12
xdotool type cd
xdotool key space
xdotool key ctrl+shift+v
Eu adicionei um atalho nas configurações do sistema - > teclado - > atalhos personalizados.
Agora, se alguém puder me dizer como ter um atalho para o script que é ativado apenas a partir do nautilus, isso seria ótimo.
Uma solução mais confiável para o problema específico pode ser encontrada aqui: