Aqui está um aviso de bug para isso:
Há um ppa com código GTK corrigido que corrige o problema
link
Posso confirmar que o código ppa corrige o problema da roda de rolagem
Rolagem é ok com um mouse no Firefox, mas não com aplicativos GTK3. Com o touch pad, a rolagem de dois dedos funciona com todos os apps.
Eu testei com xev e pegue os botões 4 e 5
Tags 13.10 mouse-wheel