Eu tive um problema parecido com o Lubuntu, e tudo que fiz foi clicar com o botão direito do mouse no relógio e abrir as configurações. Não importa o quão simples seja a caixa de diálogo, você sempre poderá ver os campos "Clock Format" e "Tooltip Format".
No primeiro, tudo que você precisa fazer é digitar %H:%M:%S , e é isso. H significa "Horas", M para "Minutos" e S para "Segundos".
Agora, se você não está acostumado, como eu, por exemplo, ao formato de data americano, que é mês / dia / ano e pode ser realmente confuso, você também pode alterar isso no segundo campo. Digite %A %d.%m.%y. . A significa nome do dia de hoje, d de "dia", m de "mês" e assim por diante.
Em vez de pontos, você pode colocar qualquer outra coisa, como / ou - , depende do que você preferir.