Sim, você pode desativá-lo facilmente executando o seguinte em gnome-terminal :
sudo rm /usr/share/indicators/session/applications/gnomecc.desktop
Isso simplesmente excluirá o link para o Centro de Controle do GNOME. Em seguida, efetue logout / login ou reinicie. Deve ficar fora depois disso; -)
No entanto, será de uma maneira diferente no Oneiric como foi respondido aqui pelo próprio Sr. Shuttleworth. ; -)