Faça o backup de seu software e configurações e instale o Ubuntu normalmente usando o seu USB ...
Você pode usar o Aptik para backup:
Aptik
- tudo o que você precisa é de um diretório de backup, armazenado localmente ou na nuvem. Aptik
fará backup de PPAs, pacotes baixados, seleções de software, configurações de aplicativos e temas e ícones. Muito útil.
Você pode instalá-lo através do ppa:
sudo apt-add-repository –y ppa:teejee2008/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install aptik
isso ajudou você? =)