Eu tive o mesmo problema. Minha configuração é intel (vídeo interno) + nvidia gtx860 (vídeo externo + primário) e 2 monitor (interno + externo).
A solução alternativa é remover o arquivo "~ / .config / monitores.xml" no comando de execução do terminal:
rm ~/.config/monitors.xml
Reconfigure a configuração do monitor após a reinicialização / relogin, o arquivo de configuração será recriado.
Pode ser que seja útil.
Mas, após o problema secundário de reinicialização / relogin, será retornado ....