Consegui resolver a minha questão depois de encontrar esta página web . Você precisa atualizar o proprietário e o grupo para cada arquivo que falhou no backup. Eu usei esses comandos para resolver a situação.
sudo chown mjwittering .cache/dconf .gvfs
sudo chgrp mjwittering .cache/dconf .gvfs
Em seguida, execute o backup novamente, que agora deve ser concluído com êxito.