O arquivo Compil_PolSARpro_v5_Linux.bat é um script de shell. Você deve executá-lo com sh Compil_PolSARpro_v5_Linux.bat dentro do subdiretório Soft da distribuição após descompactá-lo.
O link simbólico não é absolutamente necessário para executar o programa. Você só precisa executar o script PolSARpro.sh com o caminho completo, toda vez que quiser executar o programa.
O arquivo resultante é, na verdade, um script de shell, mas é denominado PolSARpro_v5.0.tcl em vez de PolSARpro.sh . Você precisará executar este arquivo com sh . Você provavelmente deve entrar em contato com a ESA para relatar esses problemas com o software. Eles realmente devem tornar isso mais fácil para as pessoas usarem.