Por padrão, o php é desativado explicitamente para / home / * / public_html. Para mudar isso no Ubuntu 14.04,
cd /etc/apache2/mods-enabled/
sudo cp php5.conf my-php5.conf
sudo rm php5.conf
e edite o my-php5.conf alterando as linhas
<IfModule mod_userdir.c>
<Directory /home/*/public_html>
php_admin_flag engine Off
</Directory>
</IfModule>
para
<IfModule mod_userdir.c>
<Directory /home/*/public_html>
# php_admin_flag engine Off
</Directory>
</IfModule>
reinicie o apache com
sudo /etc/init.d/apache2 restart
Esses comandos podem precisar de algumas alterações para outras versões do Ubuntu.