A versão bit do CD ou DVD não importa onde você a grava. Você pode até gravar uma versão para PC do 32 Bit ou 64 Bit em um Mac. O mesmo para as janelas e o mesmo se você estiver gravando um bit 32 em um PC de 64 bits ou vice-versa.
O que importa é se você quiser executá-lo depois. Recomenda-se fazer o download da versão de 64 bits se você tiver muito RAM e toda a arquitetura for de 64 bits. Isso muda se é uma dessas arquiteturas de 32 bits e 64 bits que suportam ambas.
Também não é necessário executar um 64 Bit em um PC que suporte ambos, 32 bits e 64 bits, mas tem 4 GB ou menos de memória RAM. O desempenho não será melhor se você usar o 64 Bit. Fique com o 32 Bit para mais compatibilidade nesse caso.
Portanto, em qualquer caso, não se preocupe com o local onde você gravou o tipo de CD / DVD.