Eu tenho exatamente o mesmo problema com a barra de tarefas de fallback gnome no Ubuntu 12.04 como postado aqui , os programas atualmente em execução não estão sendo exibidos na barra de tarefas mas a solução mencionada lá não funcionou para mim, como quando eu faço Alt + Right_click, nada acontece. Eu postei essa pergunta separada porque não tenho reputação suficiente para postar comentários em perguntas.
Alguém pode me ajudar com isso sem marcar como duplicata
Como você está usando a sessão de fallback do gnome, siga os seguintes passos: 1) Alt + Rclick no topo da maioria dos painéis selecione NewPanel 2) Ele adicionará um novo painel no lado direito da sua tela agora alt + clique direito no painel recém-criado no lado direito e selecione mover e mova-o para o lado inferior. 3) Feito.