Parece que seus pacotes autoconf e automake não estão atualizados, você tentou atualizá-los? se não, você pode correr:
sudo apt-get update
sudo apt-get dist-upgrade
sudo apt-get upgrade
e depois se o seu problema ainda não estiver resolvido tente instalar o autoconf e o automake novamente:
sudo apt-get install automake
sudo apt-get install autoconf