Eu experimentei um problema semelhante em que o Windows (7) se recusou a instalar em um disco particionado do MBR, enquanto outro disco particionado do GPT ainda estava conectado.
Uma lista de coisas para experimentar ou procurar:
- Remova todos os discos com tipos de tabela de partição não suportados ou converta ou faça backup e restaure para um tipo de tabela de partição suportada.
- Inicialize a mídia de instalação da maneira correta para o modo de instalação desejado ou use uma mídia de instalação atualizada que suporte máquinas de tipo UEFI mais recentes.
Alterar a tabela de partição ou o modo de inicialização requer a reinstalação ou reconfiguração dos gerenciadores de inicialização existentes.
Uma pergunta semelhante foi feita no Superusuário . Esse é um problema com o Windows, não com o Ubuntu ou com qualquer outra distribuição do Linux, a pergunta deveria ter sido perguntada onde o Windows está no tópico.