A política debian proíbe você de mexer com arquivos que pertençam a outros pacotes e / ou alterações do sistema. (ou pelo menos eu acho que faz)
Ensine seus usuários
Você pode instruir os usuários a usar purge
em vez de remove
:
sudo apt-get purge mypackage
Sobregravação automática
Se você precisar sobrescrever arquivos de configuração, o debian poderá solicitar ao usuário que instale os arquivos de configuração do mantenedor: link
One of the most annoying things about software is when you spend a great deal of time and effort customizing a program, only to have an upgrade stomp all over your changes. Debian solves this problem by marking such configuration files as conffiles. [55] When you upgrade a package, you'll be asked whether you want to keep your old configuration files or not.
Forçar novos arquivos de configuração por padrão
Você pode fazer isso automaticamente durante a atualização:
apt-get -o Dpkg::Options::="--force-confnew" dist-upgrade
Fornece / Conflita / substitui
Não tenho certeza sobre isso, mas acho que você pode limpar e substituir totalmente uma versão antiga do pacote por uma nova versão do pacote.
Leia aqui: link