Uma alternativa seria instalar o clamav, que está nos repositórios e é o FLOSS. Nós o usamos no trabalho para escanear e-mails em um ambiente multiplataforma. Você também pode usar o bitdefender que funciona bem no Ubuntu, se este for um pc de uso não comercial. Geralmente, o software antivírus não ajuda muito contra as ameaças contra o gnu / linux. Eu entendo, no entanto, que você deseja proteger a instalação do Windows contra sideload de vírus.