Não é tão desejável se você mudar a questão: em vez de desativar a GUI, instale o sistema mínimo ( não tem GUI) e faz o login no seu trabalho de aplicação (pregue isso primeiro)
Depois, se você estiver satisfeito sem a GUI (logout automático e tudo) instale a GUI, defina o login automático para um usuário diferente (que tenha uma GUI) e simplesmente alterne entre dois usuários (TTY e GUI)
Eu pessoalmente nunca fiz um login automático para um usuário TTY antes, mas não vejo por que seria impossível.