Esta é a minha nova resposta aplicável. A velha resposta dizia respeito às dificuldades de administrar o vinho. Esta nova resposta diz respeito ao problema real.
O problema que você está tendo centra-se inteiramente em um equívoco que parece ter que instalar qualquer coisa no Ubuntu você deve estar usando arquivos .exe. Você não deveria. arquivos que terminam em .exe são para windows e DOS e têm apenas usos particulares no Ubuntu, como fazer programas como o microsoft word run no Ubuntu (que é fácil usando winetricks), mas eu divago.
Para o que você está tentando fazer, você não deve usar nada que termine em .exe Se você estiver, você só terminará em falha. Durante vários meses, certos arquivos do youtube que precisam de flash têm tido dificuldade em rodar no Ubuntu, e vários de nós já testamos várias soluções, até mesmo incluindo a instalação do firefox para Windows no Ubuntu. Eu fiz isso e não resolveu o problema. O que funcionou para mim foi instalar o navegador Google Chrome, mas de forma alguma estou sugerindo que essa seja a única solução.
Como instalar o Chrome: detalhe Para instalar a versão do chrome que abre vídeos em flash sem problemas, abra este link e siga as instruções. Por favor, note que ele retornará ao Ubuntu Software Center, o qual você deveria estar usando, mas, infelizmente, não suporta essa versão do Chrome no momento.
Flash player autônomo: Em seu comentário mais recente (neste momento), você parecia indicar que queria um flash player independente. Este aqui é o melhor que posso fazer neste momento. Não creio que a instalação de uma feita para janelas usando vinho seja mais bem-sucedida.