Você pode tentar executar o Citavi no Ubuntu usando o Wine .
Por favor note que nem todas as versões do Citavi são (atualmente) suportadas pelo Wine; mais informações podem ser encontradas no site oficial do Wine:
Como faço para lidar com incompatibilidades de gerente de referência? Eu estou usando CITAVI e é apenas adequado (aparentemente) para o sistema operacional regular. Existe uma maneira de se livrar de todos esses problemas de uma vez por todas ou todo caso merece atenção especial?
Obrigado pela leitura!