Por si só, o carregador de programas de vinhos instala-se bem em todos os Ubuntus desde 8.04 (o meu primeiro Ubuntu). Para programas específicos escritos para rodar no sistema operacional Microsoft Windows, pode haver soluções necessárias para que eles sejam executados corretamente em um sistema Linux no WinE. O site winehq ( link ) mantém um banco de dados do que funciona e, se isso não acontecer, o que pode ser feito a respeito. Normalmente, eu tive que substituir / over-ride dlls padrão usando o programa winecfg. Eu sugiro que você verifique o que winehq diz sobre o software específico que você está tentando trabalhar.
No entanto, eu concordo com Graham que, para a maioria dos requisitos, os equivalentes do Linux são tão bons quanto, se não, muito melhores.