Ao adicionar aliases de servidor, ambos os virtualhost estão funcionando bem agora.
Eu gostaria de hospedar vários sites no Ubuntu 12.04, onde cada um usa um certificado SSL separado.
Eu configurei o virtualhost para cada site com diferentes origens de documentos no default_ssl.conf, mas ele funciona apenas no primeiro host virtual.
Ao adicionar aliases de servidor, ambos os virtualhost estão funcionando bem agora.