Você pode simplesmente copiar o perfil do Windows Thunderbird dentro do diretório ~/.mozilla/thunderbird
(ou pode ser que seja ~/.config/thunderbird
). Você pode renomeá-lo como padrão ou selecioná-lo na linha de comando thunderbird -P
.
Nota: Alguns caminhos podem estar errados devido a diferenças de caminho no Windows e no Linux. Você pode corrigi-los nos arquivos manualmente ou redefini-los na interface do usuário. Eu não uso o thunderbird desde há muito para ajudá-lo mais. Alguém pode te dar uma resposta mais concreta.