Eu tenho o Ubuntu em uma unidade flash e quando tento inicializá-lo, minha única opção é o gerenciador de inicialização do Windows.
Se estiver em uma unidade flash, você precisa pressionar f12 (ou o equivalente do seu computador) e selecionar o usb para inicializar a partir dele. No geral, essa é a solução mais fácil, pois mesmo a inicialização dupla normalmente com o Windows 8 tem sido uma dor para muitas pessoas.
Você tem a ordem de inicialização na sua configuração do BIOS. Verifique se o disco flash está ativado e na ordem correta. Se o seu computador for uma máquina com 8 janelas, talvez você inicialize no modo não seguro para fazê-lo.