Se você já possui partições não usadas de uma instalação anterior (corrompida) do Ubuntu, você deve escolher “alguma outra coisa” ao invés de “lado a lado” e usar a (s) partição (ões) existente (s).
A duração da redução da partição do Windows depende da quantidade a ser reduzida, da taxa de preenchimento de seus sistemas de arquivos e da taxa de transferência do seu disco rígido. 30 h para < 400 GB soa um pouco demais. Se a sua máquina tiver uma luz de atividade do disco e ela não estiver constantemente acesa ou piscando, você poderá cancelar sem maiores danos.