A partir do link , você pode escolher a segunda opção para instalar o Root Repair no Ubuntu executando os seguintes comandos em um terminal no Ubuntu:
sudo add-apt-repository ppa:yannubuntu/boot-repair
sudo sed 's/trusty/saucy/g' -i /etc/apt/sources.list.d/yannubuntu-ubuntu-boot-repair-trusty.list
sudo apt-get update
sudo apt-get install -y boot-repair && (boot-repair &)
O link acima também tem instruções sobre como usá-lo, mas a maneira mais fácil é abrir o Reparo de Inicialização e clicar em [Reparo recomendado].
Espero que isso aconteça com uma inicialização dupla.