Você tem uma referência à unidade externa no seu carregador de inicialização (grub) ou no fstab. Aposto que está no fstab.
Inicialize e verifique se o arquivo /etc/fstab contém uma referência à sua unidade externa, a linha relevante pode ter ntfs nela. Em seguida, edite esse arquivo ( nano /etc/fstab ) e exclua essa linha, salve e reinicialize. A mensagem deve agora desaparecer.