Abra um terminal e faça:
$ xrandr -q
Isso retornará algumas informações sobre como seus monitores são configurados, você terá algo assim:
Screen 0: minimum 320 x 200, current 3285 x 1080, maximum 16384 x 16384
eDP connected primary 1366x768+0+0 (normal left inverted right x axis y axis) 309mm x 173mm
1366x768 60.1*+
1280x720 59.9
1152x768 59.8
VGA-0 disconnected (normal left inverted right x axis y axis)
HDMI-0 connected 1920x1080+1366+0 (normal left inverted right x axis y axis) 480mm x 270mm
1920x1080 60.0*+ 60.0 50.0 59.9
1680x1050 59.9
1600x900 60.0
Neste caso, o eDP é o primeiro monitor e o HDMI-0 é secundário. Anote a largura em pixels da tela principal e o id da exibição secundária para poder emitir o seguinte comando:
$ xrandr --output <sec_screen_id> --pos <primary_display_width - few pixels>x0
por exemplo:
$ xrandr --output HDMI-0 --pos 1364x0
Jogue com valores diferentes até ficar satisfeito com os resultados e inclua-os em um script de inicialização (provavelmente em ~ / .xprofile).