Então, depois de um tempo, o problema foi resolvido por conta própria! Provavelmente uma atualização corrigiu isso.
Eu uso o atalho Shift+Alt para alterar o idioma da fonte de entrada e ele funciona bem em todos os lugares, exceto na tela de login e ao acordar da suspensão. Isso é um bug ou estou faltando alguma coisa?
Estou usando o Ubuntu 14.04 LTS.
Então, depois de um tempo, o problema foi resolvido por conta própria! Provavelmente uma atualização corrigiu isso.
Abra um terminal e execute:
gksu gedit /etc/default/keyboard
(ou use outro editor de texto)
Faça as seguintes alterações no arquivo:
XKBLAYOUT="de,us"
XKBVARIANT=""
XKBOPTIONS="grp:alt_shift_toggle"
(Substitua de nós pelos seus idiomas)
Reinicie e tente novamente.