Você deve descompactar manualmente o deb, colocar arquivos em algum lugar e garantir que tenha acesso às bibliotecas necessárias. O comando Chroot pode ajudar a usar o dpkg ou o apt-get, embora eu não ache que muitas pessoas o tenham feito. Se você quer fazer uma máquina, onde você não precisa de root passwd, você deve usar sudo extensivamente. O Sudo pode ser ajustado para permitir somente determinados comandos com determinados parâmetros sem senha.