Você tem muitas possibilidades.
1) Prepare um conjunto inteiro de bibliotecas atualizadas. Coloque-os, digamos, / catbed. Então é só correr
/catbed/ld-linux.so.3 --library-path=/catbed:/whatever-else /usr/bin/app
2) Melhor ainda, use chroot
. E debootstrap
. E schroot
3) Melhor ainda, substitua LD_LIBRARY_PATH ao executar seu aplicativo.