Não tenho certeza se o problema persistir, mas adiciono o que eu vejo no Ubuntu 14.04 para que ele fique completo.
Eu posso facilmente adicionar / etc aos meus locais de backup no deja dup e o backup é feito. No entanto, existem pastas que não são legíveis a ninguém que não seja o seu proprietário, o que faz sentido, p. para determinados serviços do sistema, senhas de usuários ou chaves de criptografia privadas. Não é aconselhável alterar as suas permissões para, e. grupo ou mesmo legibilidade do mundo, pois isso reduziria a segurança do sistema. Para alguns arquivos que possuem uma capacidade de leitura limitada, é possível adicionar os usuários que precisam fazer backup deles nos grupos correspondentes, como shadow, mas que eu ainda não recomendaria.
Após o término do backup, haverá uma tela mostrando os arquivos que não puderam ser salvos em backup e que você precisa confirmar todas as vezes.