Você precisa instalar o GRUB na mesma partição que o Windows:
1) Inicialize com o Ubuntu Live CD (ou USB)
2) Abra o terminal (prompt de comando)
3) Tipo:
sudo fdisk -l
Você receberá uma lista de partições, semelhante à lista a seguir:
/dev/sda1 13 102400 de Dell Utility
/dev/sda2 * 13 1926 15360000 7 HPFS/NTFS
/dev/sda3 1926 30892 232676566 7 HPFS/NTFS
/dev/sda4 30893 60802 240245761 5 Extended
/dev/sda5 30893 59584 230467584 83 Linux
/dev/sda6 59585 60802 9777152 82 Linux swap / Solaris
A partição do Ubuntu é aquela com o nome "Linux" (não necessariamente aquela com a estrela, embora possa ser). A partição do Windows normalmente é aquela com o NTFS.
A partição Linux neste exemplo (mas você deve tentar a partição Linux ou Windows. Acredito que no seu caso funcionaria na partição Windows), está em '/ dev / sda5' então temos que montar isso:
4) Substitua o seguinte comando 'sda5' pelo nome da partição no seu caso:
sudo mount /dev/sda5 /mnt
5) E depois instalar o grub:
sudo grub-install --root-directory=/mnt /dev/sda
6) Reinicie e verifique se tudo está funcionando bem.
Espero que ajude!