Você pode usar testdisk
instale
sudo apt-get install testdisk
conecte a unidade externa e execute
sudo testdisk
selecione > [sem log]
selecione a unidade externa a partir das opções pressione > [prosseguir] > [intel]
e use > [analisar] > [pesquisa rápida] > [pesquisa detalhada]
ele analisará a unidade e fornecerá a lista de arquivos arquivos excluídos serão vermelhos você pode copiá-los para o lugar desejado.