Parece que você quer que uma instalação completa pisque. Desconecte / desative sua unidade interna, conecte sua unidade flash e instale-a usando o Live DVD ou Live USB. Eu faço a primeira partição FAT32 ou NTFS, então eu também posso usar a unidade flash para dados em uma máquina Windows.
Aqui está a versão longa passo a passo para 12.04:
Desligue e desconecte o computador. (Veja nota na parte inferior) Remova o lado do estojo. Desconecte o cabo de alimentação do disco rígido. Conecte o computador novamente. Insira o pen drive. Insira o Live CD ou o Live USB. Inicie o computador, o CD / USB deve inicializar. Selecione o idioma Selecione instalar o Ubuntu. Selecione Baixar atualizações durante a instalação e selecione Instalar este software de terceiros. Continuar Em "Tipo de instalação", selecione "Outra coisa". Continuar Confirme se o dispositivo está correto. Selecione "Nova Tabela de Partição" Clique em Continuar no menu suspenso.
(partição opcional para uso na máquina Windows) Clique em "Espaço livre" e "Adicionar". Selecione "Primário". Torne "Novo tamanho da partição ..." com cerca de 1.000 megabytes. Localização = início. "Use as:"="Sistema de arquivos FAT32". E "ponto de montagem" = / windows. Selecione "OK"
Clique em "espaço livre" e depois em "Adicionar". Selecione "Primário", "Novo tamanho da partição ..." = 4000 a 6000 megabytes, Início, Ext4 e Ponto de montagem="/" e depois OK.
(partição inicial opcional) Clique em "espaço livre" e depois em "Adicionar". Selecione "Primário", "Novo tamanho da partição ..." = 1000 a 4000 megabytes, Início, Ext2 e Ponto de montagem="/ home" e depois OK.
(espaço de troca opcional, permite a hibernação) Clique em "espaço livre" e depois em "Adicionar". Selecione "Primário", "Novo tamanho da partição ..." = espaço restante, (1000 a 2000 megabytes, ou mesmo tamanho da RAM), Início e "Usar como"="área de troca" e depois OK.
(importante) Confirme se "Dispositivo para instalação do carregador de inicialização" aponta para a unidade USB. O padrão deve estar ok se o HDD estiver desconectado.
Clique em "Instalar agora". Selecione sua localização. Continuar. Selecione o layout do teclado. Continuar. Insira seu nome, nome de usuário, senha, nome do computador e selecione se deseja efetuar login automaticamente ou solicitar uma senha. A seleção de "Criptografar minha pasta pessoal" é uma boa opção se você estiver preocupado em perder sua unidade USB. Selecione Continuar.
Aguarde até que a instalação esteja concluída. Desligue o computador e conecte o HDD. Cole o painel lateral de volta.
Nota: Você pode omitir a desativação do disco rígido se, ao particionar, você optar por instalar o grub na raiz da unidade usb para a qual você está instalando o Ubuntu (ou seja, sdb não sdb1). Seja cauteloso, muitas pessoas substituíram o MBR do HDD. Você pode revisar o grub depois, se desejar.
Editar: Se você instalar os drivers ATI em sua unidade flash de instalação completa, ele deverá ser inicializado em computadores que usam gráficos ATI, mas não em computadores que usam gráficos Intel ou Nvidia. Você não pode instalar drivers gráficos em uma unidade flash persistente.