Você pode encontrar a maioria dos detalhes aqui
Existem dois arquivos que você precisa ver. O /etc/X11/xorg.conf e o arquivo apropriado, dependendo do seu gerenciador de área de trabalho (Gnome, KDE etc.)
Se você estiver tentando fazer vários itens de uma placa gráfica, será um processo diferente e, até onde eu sei, possível com software extra, mas mais difícil. Parece que você está usando duas placas de vídeo diferentes, então você deve estar seguro.
Configurar os arquivos DE (ambiente de área de trabalho) é bastante fácil e você pode encontrar as instruções no link acima. Para o xorg, você precisará fazer a maioria dos detalhes. Leia sobre esta página . A idéia é vincular suas telas, entradas, monitores, dispositivos, etc. ao conjunto ServerLayout apropriado em seu arquivo de configuração DE.
Divirta-se e boa sorte!