No final, acabei de adotar a abordagem deselegante de desconectar o segundo HDD e refazer a instalação do Ubuntu na única unidade principal. Desta vez, ele me perguntou como descrito nas etapas de instalação para alocar espaço entre o Windows e o Ubuntu. Eu reconectei a segunda unidade e na reinicialização, recebi as opções de prompt de inicialização dupla. Deve haver uma abordagem mais elegante, mas isso resolveu o problema.
Peter