Eu costumava usar isso .. Eu tentei agora em 12.04 com o Gnome Shell 3.4 e funcionou. Basta ligar o seu monitor externo, colocá-lo onde quiser (superior, esquerda, direita ..) e no terminal executar este comando:
xrandr --output VGA1 --primary
Espero que seja o que você está procurando.