A duplicidade usa a API REST para falar diretamente com o servidor do Ubuntu One. Você deve fazer o mesmo em qualquer programa em que deseja armazenar o conteúdo diretamente no servidor.
No entanto, se o cliente Ubuntu One estiver configurado para assinar automaticamente qualquer pasta no servidor, os dados serão automaticamente sincronizados novamente na máquina local. O Ubuntu One File Sync é um serviço de sincronização, não um arquivo remoto.