O evolution-mapi usa o protocolo nativo do Outlook. Não há nenhum plugin para o Thunderbird que faça isso no Linux.
O evolution-exchange basicamente usa a captura de tela do serviço da web do Exchange. Isso só funciona com versões mais antigas do Exchange. Pode haver plugins que fornecem esse tipo de suporte para e-mail no Thunderbird, mas ainda não vi nenhum.
No momento, sua melhor opção é ativar o IMAP no servidor ou usar a evolução.