Se você não tiver nenhum requisito específico que force você a usar o Eclipse 3.8, sugiro que você obtenha uma versão nunca do Eclipse. Se você der uma olhada em This Pergunta no Ubuntu você tem uma boa descrição de como instalar o Eclipse da fonte.
Eu tenho o Ubuntu 13.10 e o Eclipse 3.8 do Ubuntu Software Center. Onde obtenho um Eclipse CDT compatível? Eu fui ao site do Eclipse, mas ele não parecia fornecer um CDT para o Eclpise 3.8. Se o site do Eclipse fornecer um CDT compatível, não consegui encontrá-lo.