Tente instalar o editor-dconf e verifique as configurações em org / gnome / desktop / input-sources. Lá você verá as opções xkb e poderá alterá-las permanentemente.
Alguns dias atrás, antes de eu mudar de 13.04 para 13.10, meu teclado começou a aparecer com as opções ctrl:swapcaps e japan:nicola_f_bs .
Não percebendo no momento em que setxkbmap -option resolveria o problema temporariamente, eu comprei outro teclado que funcionava da mesma forma. O arquivo /etc/defaults/keyboard mostra as configurações corretas, mas é datado do dia que eu instalei 13.10. Portanto, não é a fonte do problema.
Como posso encontrar e corrigir a origem dessas opções ímpares?
Tente instalar o editor-dconf e verifique as configurações em org / gnome / desktop / input-sources. Lá você verá as opções xkb e poderá alterá-las permanentemente.