Execute o seguinte em um terminal
synclient ClickFinger3=0
synclient TapButton3=0
Se isso funcionar (ou uma variação de 0, 1, 2, 3,), você poderá adicioná-lo à inicialização.
(note que eu não tenho um macbook, mas funciona no meu asus. Por favor, deixe-me saber se isso não faz nada)