Esta não é minha resposta, mas sim "Solução para Lubuntu (PCManFM):"
vá para /home/USER/.config/pcmanfm/default/
ou /home/USER/.config/pcmanfm/lubuntu/
.
altere USER com seu nome de usuário
sudo nano pcmanfm.conf
vá para a seção "[desktop]", altere sort_by
para sort_by=2
(se você quiser classificar por nome)
logout - > log in
Eu não sou um especialista, provavelmente há uma maneira mais agradável de fazer isso com o script bash ou algo assim ... mas isso funciona e é necessário ser feito apenas uma vez. Sobre a ordenação de números Não tenho certeza de qual deles é o que e não encontrei nenhuma informação útil, por isso você precisará descobrir por si mesmo jogando ou encontrando alguma informação.
Não sei se algo semelhante funcionaria para o Ubuntu e o nautilus.