O motivo da falha é provavelmente um bug. Você deve denunciá-lo. Se você quiser alterar a propriedade, poderá usar:
sudo chown -R someuser:somegroup /usr/share/solr-4.5.1/example/solr/
Cuidado para não estragar outra coisa.
% bl0ck_qu0te%Você não pode alterar a propriedade de arquivos que não são mais seus, o que provavelmente é a causa da queda do Nautilus.