Se estiver no lado do Ubuntu, verifique estes dois arquivos
/etc/modprobe.d/blacklist.conf
Remova a lista negra usb_storage se ela estiver lá e salve o arquivo.
/etc/rc.local
remova modprobe -r usb_storage se estiver lá e salve o arquivo.
Agora reinicie seu sistema e sua porta USB funcionará, a menos que exista qualquer problema de hardware.