Hmmm, não ser capaz de ver alguns arquivos parece meio estranho. Pode ser necessário alterar a propriedade de tudo (desde que sejam apenas arquivos de sua pasta / home e não de arquivos importantes que dependam de sua propriedade, como arquivos / etc). Para fazer uma alteração recursiva de propriedade, acredito que find /path/to/external -exec chown Admin:Admin {} \;
Altere o caminho / caminho / para / externo para o caminho para a unidade externa e Admin para o nome de usuário exato que você deseja ter acesso aos arquivos.
A sintaxe para encontrar pode ser engraçada, como o cólon escapado e os colchetes, mas deve funcionar. Localizar apenas lista todos os arquivos e pastas se não tiver um nome específico para procurar, o sinalizador -exec informa que você deseja executar algum outro comando shell e passar um por vez os arquivos que encontrar, o {} é o lugar titular onde cada nome de arquivo será passado e, em seguida, o comando será executado. Você pode precisar de um sudo ou dois lá dentro.
Você também tentou sudo su root e deu uma olhada assim? Embora isso seja da linha de comando, não do gui.